Düşüncelere Özğürlük, saygın insan hakları kuruluşları ile partnerlik anlaşması bulunmaktadır ve kollektif çalışmalar yürütmektedir. Bu insan hakları kuruluşları yaptıkları başvurular ile BM Keyfi Tutuklamalar Çalışma Grubu ve diğer BM mekanizmalarında önemli davalar takip etmiş ve hak ihlallerini tespit etmişlerdir.
Birlikte çalıştığımız insan hakları kuruluşları, Bahreyn’den Americans for Democracy & Human Rights in Bahrain(ADHRB)
Polonya’da, özellikle Polonya - Belarus sınırındaki insan Hakları ihlalleri konusunda yaptıkları çalışmalar ile tanınan Wolno Nam insan hakları kuruluşudur
Yine Polonya’da bulunan ve Tacikistan ‘daki insan hakları ihlallerini takip eden, keyfi tutuklamaları BM Keyfi Tutuklamlar Çalışma Grubunda takip eden Buzurgmehr adlı kuruluştur
